經(jīng)過(guò)我們多年生產(chǎn)實(shí)踐栽培總結出來(lái)的經(jīng)驗是選用當年表現優(yōu)異的羊肚菌子實(shí)體進(jìn)行組織分離以后，再繁育出來(lái)的菌種進(jìn)行栽培播種，由于轉代次數少，變異性概率低。再進(jìn)行播種，基本可以保障穩定的出菇率。綜上所述，掌握成熟的羊肚菌育種技術(shù)是必要的。以下為大家詳細的介紹羊肚菌菌種分離及提純復壯技術(shù)：
一，選種菇  正常情況在清晨還沒(méi)有澆水之前采摘6分熟的，沒(méi)有病害感染，蟲(chóng)害咬食的健康羊肚菌作為種菇，還要看菇形與其母本的外觀(guān)形態(tài)相似度越高越好。采菇以后不要帶土裝入塑料袋中，根據不同品種寫(xiě)好標簽。
二，種菇處理  將采到的種菇進(jìn)行測量，稱(chēng)重，并做好詳細記錄，測試種菇高，菌柄直徑，菌帽直徑，和菌帽高度。

三，準備工作  將制備好的PDA 培養基試管，無(wú)菌水，儲水罐，酒精棉，無(wú)菌棉攝子，酒精燈，火機，種菇等物品放到無(wú)菌操作臺上，將殺菌燈開(kāi)好，無(wú)菌風(fēng)機同時(shí)打開(kāi)，20分鐘后就可以進(jìn)行分離羊肚菌菌種的操作了。也可以在接種箱中進(jìn)行，把上述物品全部放入接種箱。接種箱封閉好以后用二氯異氰悄酸納薰蒸30分鐘即可開(kāi)始分離羊肚菌菌種的工作了。

四，分離菌種  1，帶好手套，伸入無(wú)菌操作臺的無(wú)菌區，或接種箱內，先用酒精棉球對雙手手套外表進(jìn)行徹底擦拭消毒，然后用無(wú)菌水對羊肚菌種菇進(jìn)行沖洗沖洗過(guò)程的水倒入儲水罐中，內外都要沖洗，沖洗時(shí)間為2-3分鐘，沖洗以后用無(wú)菌棉吸干羊肚菌表面水分。然后將攝子用酒精棉消毒處理以后，放在酒精燈火焰順風(fēng)方向燃燒消毒，再將羊肚菌菌帽與菌柄處掰斷，將菇帽部分放到一邊，只用菌柄部分，再拿起一支試管（試管和菌柄同時(shí)用左手拿好，在酒精燈火焰順風(fēng)處取下棉塞，棉塞夾在右手中指和無(wú)名指之間，注意塞入試管部分的棉塞向外，不要與手接觸，右手的拇指和食指拿攝子夾取菌柄與菌帽斷開(kāi)處的3毫米見(jiàn)方的一塊羊肚菌組織，接入試管斜面培養基前端，塞好棉塞，放在旁邊，注意始終保持試管培養基平面向下，輕拿輕放。然后再進(jìn)行下一支試管的操作。

五，培養  將分離好的菌種貼好標簽：標簽內容包括日期，品種名稱(chēng)等信息。然后就可以放在20-23度的條件下恒溫培養。注意每天觀(guān)察長(cháng)勢，雜菌感染嚴重的及時(shí)挑出。感染輕微的可以保留進(jìn)行提純處理。

六，提純  在分離的過(guò)程中，難免有雜菌感染，根據羊肚菌菌絲生長(cháng)速度快的特點(diǎn)，即使有羊肚菌菌絲與雜菌共同萌發(fā)生長(cháng)，經(jīng)過(guò)三天培養，羊肚菌菌絲長(cháng)勢會(huì )超過(guò)雜菌一大截，遇到這種情況時(shí)就可以進(jìn)行提純處理：
1，準備工作：準備提純的菌種，空PDA試管培養基，酒精燈，酒精棉，接種鉤，火機。消毒處理和上述方法一致。
2，提純流程  戴好手套，用酒精棉擦拭消毒，將接種鉤擦拭消毒，然后在酒精燈火焰順風(fēng)方向取下等待提純菌種試管棉塞，用接種鉤在酒精燈火焰處灼燒消毒處理以后將原來(lái)接入的已經(jīng)感染雜菌的組織塊部位的培養基一同鉤出試管，沒(méi)有感染雜菌長(cháng)有羊肚菌菌絲的培養基保留1-2厘米即可。注意接種鉤盡量不要接觸到雜菌感染的部分。然后仔細對接種鉤進(jìn)行徹底消毒處理以后就可以取保留的羊肚菌純菌絲接入新的PDA培養基中，大小以3毫米見(jiàn)方一塊為宜。然后將提純后的試管貼好標簽，做好記錄。再放到20-23度進(jìn)行恒溫培養。
七，菌種保藏   分離，提純好的羊肚菌菌種以后需要及時(shí)進(jìn)行菌種保藏處理，具體請參照菌種保藏方法 在適當的季節進(jìn)行出菇栽培實(shí)驗。